1、同盟会成立后，孙中山加紧组织起义的工作，自己往南洋一带发展革命组织，筹措革命经费，当时，孙中山不仅遭到清政府通缉，而且遭到香港殖民当局以及日本的驱逐，被迫在国外到处流亡，已经很久无法践履国土，因而很难深入内地指挥革命。

2、孙中山在南方主持革命起义，屡遭失败，而同盟会本部的工作却无人过问，影响到孙中山的威信。光复会系统的章太炎、陶成章等人，受传统思维的影响比较大，与孙中山有不同的政治见解，中国同盟会在思想和组织上一直处于非常松散的状态。

3、起义失败后，受孙中山领导的黄兴负伤逃回香港，喻培伦、方声洞，林觉民等被捕杀，死难的同盟会会员有86人，其中72人的遗骸由潘达微等出面收葬于广州东郊红花岗，并把红花岗改名为黄花，这次起义因而被称为“黄花岗起义”。