1、一线工程穿过的主要地形区有：塔里木盆地；吐鲁番盆地；河西走廊；宁夏平原；黄土高原；华北平原；长江中下游平原。其起点为塔里木盆地。

2、二线工程穿过的主要地形区有：准噶尔盆地；河西走廊；宁夏平原；黄土高原；华北平原；江汉平原；鄱阳湖平原；江南丘陵；华南丘陵；珠江三角洲。其起点为准噶尔盆地。

3、一线工程沿途经过主要省级行政区：新疆；甘肃；宁夏；陕西；山西；安徽；江苏；上海。

4、二线工程沿途经过主要省级行政区：新疆；甘肃；宁夏；陕西；河南；湖北；江西；广东。