防伪税控中的客户编码的设置方法如下：

1、点击电脑桌面系统上的开票软件图标打开税控开票系统，输入账户信息登入税控系统；

2、在窗口页面上找到客户编码选项并点击进入，或者在窗口菜单栏内点击编码管理，在弹出的下拉框内选择“客户管理”选项；

3、在弹出的客户编码设置窗口内的左边目录框内找到客户编码文件夹，单击右键，在弹出的选项框内选择“增加分类”。可以根据客户重要类型需要分类创建文件夹；

4、创建好分类文件夹后，点击选中，在客户编码设置大窗口的右边找到增加选项并点击；

5、在客户编码添加小窗口内根据开发票的要求填写客户信息，如果是开具普通发票的客户可直接填写客户名称和税号即可，如果是开具专用发票的客户，需填写地址电话和开户行信息；

6、在填写好客户的开票信息后，点击小窗口左上角的保存按钮即可。