1、所有权：小产权房没有国家房管部门颁发的房产证，且是有使用权，没有所有权。而大产权房有国家房管部门颁发的房产证。

2、法律效力：小产权房的建设用地一般是归集体所有，只能由这个乡的村民购买居住，对于外人购买，一般没有法律效力。

3、房产转让：小产权房的装让要缴纳土地出让金，大产权房不需要。且小产权房只能在村集体内流转，所以转让对象有所限制。

4、风险：小产权房面临的政策风险高，如果相关部门整顿小产权房的建设，可能就会导致部分房屋停建甚至被强迫拆除。