蜂巢的内部结构称为蜂房，蜂房由一系列以蜂蜡制作，紧密排列的六角柱体蜂室所组成，这种六角形所排列而成的结构叫做蜂窝结构。蜂巢内外面的巢穴刚好一半相互错开，相互组合六角形的边交叉的点是内侧六角形的中心。这是为了提高强度，防止巢房底破裂。另外，从剖面图可知，两面的巢房方向都是朝上的。工蜂在巢房中哺育幼虫，贮藏蜂蜜和花粉，蜂巢形成9至14度左右的角度，以防止蜂蜜流出。

蜂巢药用价值很高，常用新鲜干净的蜂巢治疗鼻炎。研究表明，蜂巢制剂有促进机体细胞免疫功能的作用，蜂巢浸液既对乙型肝炎表面抗原有灭活作用，也对金黄色葡萄球菌、绿脓杆菌、大肠杆菌、痢疾杆菌、伤寒杆菌和普通变形杆菌等都有很强的抑制力；对烟曲霉、黄曲霉、茄镰菌、明串珠菌等真菌也有抑制作用。蜂巢的化学成分很复杂，主要含有蜂蜡、树脂、油脂、色素、鞣质、糖类、有机酸、脂肪酸、甙类、酶和昆虫激素等。