很多教辅资料都认为叶绿体是植物细胞特有的细胞器。而人教版必修1教材P.114和选修3教材P.38都提到，原生动物眼虫也有叶绿体。

（一）按照“五界分类法”来分，眼虫属于原生生物界。其主要特征是单细胞，真核，如衣藻、草履虫、变形虫、小球藻等。据上所述，叶绿体是植物细胞特有的细胞器是不严谨的，可以说叶绿体是真核自养生物所特有的。

（二）叶绿体是植物细胞所特有的细胞器这个结论的产生是有背景的，不能孤立来看，是植物细胞和动物细胞进行比较而得出的，不能断章取义。准确的说，与动物细胞相比，叶绿体是植物细胞所特有的细胞器。

（三）早在18世纪，林奈将生物分为植物界和动物界，虽然当时已经发现了原生动物（1674年列文虎克），但当时并没有被包含进去（因为当时主要以肉眼能看到的特征来分类），这就是两界系统。1866年，海克尔将介于动物和植物之间的原始单细胞生物建立了一个新界，原生生物界。这就是三界系统。1959年，魏克泰将不含叶绿素的真核菌类从植物界中分出，建立真菌界，形成四界系统。1969年，魏克泰又根据细胞结构和营养类型将生物分为动物界、植物界、原生生物界、原核生物界、菌物界（真菌界），形成五界系统。20世纪70年代，陈世骧把类病毒和病毒另立病毒界，形成六界系统。从各种分界系统可以看出，无论两界、三界、四界、五界还是六界分类系统，原生动物都不属于动物界也不属于植物界。由于眼虫（原生动物）有叶绿体，所以“叶绿体是植物特有的细胞器”的说法不准确。准确的说，与动物细胞相比，叶绿体是植物细胞所特有的细胞器。