2016年9月10日14时，莫兰蒂在西北太平洋洋面上生成。9月11日14时加强为强热带风暴。9月12日02时加强为台风，08时加强为强台风，11时继续加强为超强台风级。9月13日晚间加强到顶峰强度70m/s（年鉴上调至75m/s）。

9月15日以强台风级在中国福建省厦门市登陆，登陆时中心最大风力48m/s（年鉴上调至52m/s，超强台风），重创厦门市。17时减弱为热带低压。9月16日凌晨在中国黄海海域消散。

台风莫兰蒂导致厦门市65万棵树倒伏，房屋损毁17907间，农作物受灾面积10.5万亩，直接经济损失102亿元。在中国大陆共造成28人死亡、49人受伤、18人失踪。台风莫兰蒂擦过台湾南部时也给台湾造成严重影响，当地因灾死亡2人。

2017年02月21日-24日，在日本横滨举行的第49届台风委员会年度会议上，台风委员会决定将“莫兰蒂”除名。