首先，很明确地说，领导职务和非领导职务的工资是不一样的。具体来讲，同样是副科级，副科级实职和副主任科员的工资是不一样的，主要体现在岗位工资上。同类，处级干部和调研中的工资也是不一样的。具体差距，和岗位工资级别有关，但是大家习惯上说同一级另的非领导职务和领导职务，工资“差半级”。科级干部岗位工资差不到一百，县级干部比一百稍多点，但差距是实实在在的存在的。

其次，领导职务是实职，是机构编制部门在核定三定方案的时候，明确在“领导职数”一项中，核定的职数、级别，组织部门严格按此配置，严禁超职数配备领导干部。而非领导职务，是组织部门为了解决干部级别待遇，自行设置的领导级别和数额限制，不经机构编制部门核定，也不写入单位的“三定方案”中的领导职数。一般按组织部门的规定来讲，非领导职务设置为领导职数的三分之一，最多不超过一半。也就是说，单位核定三个领导职数，一般配备一个非领导职务。

第三，非领导职务只是一种工资待遇、个人待遇，并非真正的领导干部，其分工都是协助领导班子成员工作，一般不单独承担领导分工，不单独承担领导责任。其使用的编制，也和其他一般人员一样，论资排辈，并不像核定的领导职数一样优先使用编制。举个例子，某局副局长，使用的就是副局长的编制，即使组织部门未能及时配备，其编制也应该空缺出来。如果在空缺期间其编制被其他人占据，在组织部门配备后，也应该腾退出来，供副局长使用。而非领导职务则不同，不仅要和一般人员挤编制，即使未能使用编制，也不能将一般人员已经使用的编制，专门退出使用，给非领导职务腾退。非领导职务无此优待权力，也没有规定必须如此，这一点是与领导职务有严格区别的。

至于领导职务和非领导职务选哪个，因人而异。对于距离退休年龄不足五年的领导干部来讲，因为个人身体和精力原因，可以向组织要求退居二线，担任非领导职务。对于年富力强的领导干部来讲，如果条件具备，当然优先选择领导职务。

新《公务员法》颁布实施之后，非领导职务全部取消，仅成为一种工资待遇，从低到高分为二级、一级科员，四级、三级、二级、一级主任科员，四级、三级、二级、一级调研员，二级、一级巡视员，不再称呼为非领导职务，仅体现在工资档案上。其认定也不再由组织部门自行规定，而是按实施细则自行晋升，二级主任科员以上全有条件限制。