1、时队和暗队剧情都是一模一样的，只不过有些细节不一样而已，比如不同种类软糖的出现率，时版限定雪拉比，暗版限定超梦等。

2、两个版本都只有491种PM空队相当于是时暗的资料片，新增了492和493，二周目增加了天空之顶剧情，新增了分别以龅牙狸、向日花怪、胖可丁、魅力探险队和森林蜥蜴为主角的特别剧情。

3、时或者暗和空的关系可以理解为钻石或者珍珠和白金的关系，时和暗的密码通用，空队密码就和前两个版本不一样，三个版本一周目最终BOSS都是暗黑迪亚鲁加，二周目最终BOSS为噩梦神，帕鲁基亚是二周目的一个BOSS，冥王龙则要通过官方密码开启迷宫才能见到。