16所，排前五名的是厦门大学、集美大学、厦门理工学院、厦门医学院、厦门华夏学院。

厦门大学是我国唯一地处经济特区的国家“211工程”和“985工程”重点建设的高水平大学。

集美大学是省属多科性大学，是福建省重点建设高校、福建省本科一批招生高校、交通运输部与福建省共建高校、博士学位授予单位。

厦门理工学院获评省“先进基层党组织”，被誉为“地方经济的人才摇篮”，“福建省最受考生欢迎的高校之一”等。

厦门医学院由闽南唯一的公立护士学校-厦门护士职业学校、厦门医士学校和厦门第二医院护士学校合并而成。

厦门华夏学院是由厦门市政协举办的厦门市首家民办全日制普通高等职业学院，属完全公益性的教育机构。