商业房产证上是可以注明份额的。按照我国相关规定，房屋产权可以为多人共同拥有的财产，也就是说房屋产权证上可以写多人的名字，因此，也可以在房产证上具体的写明产权人所占的份额。如果在购买房屋时没有约定或者对份额没有具体声明的，购买方的份额应该按照购买房屋时的出资额确定，如果出资额不能确定的，就按照双方等量确定。房屋属于不动产，可以有多个单位及个人共有，共有包括了份额共有和共同共有。份额共有即按照份额共有，对房屋的产权按照份额划分所有权份额。按照相关规定，不动产权的设立、变更、转让以及消失，是需要依法登记的，如果没有登记，是不具有效力的。根据我国颁布的《房屋登记办法》中第十三条规定，共有房屋，应当有共有人共同申请登记，房屋登记中应该写明份额，就是按照份额共有房屋的所有权，房地产登记机关应该依法为公民办理，并且留有相关的证明材料。