马蹄莲花有毒，内含大量草本钙结晶和生物碱，误食会引起昏眠等中毒症状。该物种为中国植物图谱数据库收录的无毒植物，其毒性为块茎、佛焰苞和肉穗花序有毒。咀嚼一小块块茎可引起舌喉肿痛。一位8岁的女孩因食花序而中毒，昏迷12小时、24小时后恢复。 马蹄莲可药用，具有清热解毒的功效。治烫伤，鲜马蹄莲块茎适量，捣烂外敷。预防破伤风，在创伤处，用马蹄莲块茎捣烂外敷。马蹄莲有毒， 禁忌内服。此植物全身有毒，误食一点点都会引起呕吐，但煮过后可以喂野猪，煮过的叶子可以治轻微头痛，但药用都必须在医生的指导下使用。