黄花菜最好不要和粗纤维的东西如地瓜之类一起吃。容易拉肚子，不要和热气的东西如油条一起吃太多，容易生痰热。黄花菜与鹅肉同食损伤脾胃;与兔肉、柿子同食导致腹泻，同时黄花菜不宜与甲鱼、鲤鱼、豆浆、茶同食。黄花菜的花有健胃、通乳、补血的功效，哺乳期妇女乳汁分泌不足者食之，可起到通乳下奶的作用，根有利尿、消肿的功效，可用于治疗浮肿，小便不利，叶有安神的作用，能治疗神经衰弱，心烦不眠，体虚浮肿等症。习惯上各种萱草的根入药不分，而作为食用只用黄花萱草的花蕾。