仓鼠是小到大身体紧凑的鼠形啮齿动物。体型短粗，体重30～1000克 。尾部长度范围从7到106毫米，一般是体长的一半，无鳞，上覆密毛，少数种类（如沙漠小仓鼠 ）则很短，不及后足的一半；某些物种的雌性比雄性大。尾毛色差异较大，一般为灰色、灰褐或沙褐色，原仓鼠毛色比较鲜艳，背部红褐色，腹部黑。仓鼠有长而厚的毛皮。它们在背面上是灰色的，粉红色的浅黄色，浅棕色或红棕色，在腹面上是白色，灰色或黑色。它们的侧腹部也常常是白色的，一些有中间条纹和皮脂腺侧腺。

臼齿齿突瘤状，排成两纵列，左右齿突不相对或近乎相对。仓鼠有双腔胃，大多数没有胆囊。他们的大肠和盲肠中度复杂。仓鼠的二倍体染色体数目在20至44之间。有13个胸椎和6个腰椎的脊柱。