清除鱼塘蓝藻首先要加强硝化系统，加入硝化细菌来解决，从而维护水质。降低由于盐碱土质、蓝绿藻爆发造成的pH值偏高，维持养殖池塘的生态平衡。调水、护水、肥水培藻前，先消除水体中的毒素、有害微生物代谢的毒素、药物残留、重金属残留等。

养殖水产动物的最怕就是水体变色，只要是出现水体变色就说明水产品要面临一场极大的病害，但是传统改变水质浑浊的办法是在水里边泼洒换血物质，如果操作不当会造成二次污染。可以用微生物相互作用来调节水质，自然界的微生物分为有益微生物和有害微生物，em菌是一群有益微生物集群能够通过自身的活动杀死有害物质，增强水体的有益菌类使水体自我调节能力增强，从而达到生态环保目的。